คุณภาพการผลิตและผลิตภัณฑ์ที่ปลอดภัยเป็นหนึ่งในเรื่องที่เบทาโกรให้ความสำคัญเป็นลำดับสูงสุด โดยดำรงระบบควบคุมคุณภาพที่เข้มงวดในทุกขั้นตอนของการผลิต นับตั้งแต่การผลิตอาหารสัตว์ ไปจนถึงการเลี้ยงปศุสัตว์ และการแปรรูปอาหารที่โรงงาน รวมไปถึงจุดจำหน่าย เพราะเชื่อว่าการบูรณาการธุรกิจของบริษัทฯ ทำให้สามารถติดตามควบคุมการดำเนินงานได้อย่างใกล้ชิด เพื่อให้มั่นใจว่าบริษัทฯ ปฏิบัติตามมาตรฐานความปลอดภัยด้านอาหารระหว่างประเทศตลอดทั่วทั้งห่วงโซ่อุปทาน นอกจากนี้ ได้ใช้ระบบที่ทำให้สามารถตรวจสอบผลิตภัณฑ์ของบริษัทฯ ย้อนกลับไปยังแหล่งที่มาได้ในทุกขั้นตอนของกระบวนการผลิต

ทั้งนี้ เบทาโกรยังมีการติดตามตรวจสอบกระบวนการผลิตอย่างต่อเนื่องทั้งการตรวจสอบระบบประกันคุณภาพ และระบบการบริหารคุณภาพ อีกทั้งมีเป้าหมายลดความเสี่ยงจากการปนเปื้อนของผลิตภัณฑ์ โดยนำหลักการการประเมินความเสี่ยงทุกขั้นตอนการผลิตและปฏิบัติด้านสุขอนามัยที่เข้มงวด และการติดตามตรวจสอบและรับมืออย่างสม่ำเสมอ และยึดถือตามระบบต่าง ๆ ซึ่งรวมถึงวิธีปฏิบัติในการจัดเก็บและขนย้ายผลิตภัณฑ์ที่ถูกต้อง การใช้สิ่งอำนวยความสะดวกและเครื่องมือที่เหมาะสมเพื่อให้มั่นใจถึงคุณภาพและความสดใหม่ของผลิตภัณฑ์ และที่สำคัญ การผลิตอาหารของบริษัทฯ อยู่ภายใต้การควบคุมเพื่อให้มั่นใจว่าผลิตภัณฑ์ปราศจากสารเคมีตกค้างและการปนเปื้อน เชื้อก่อโรคที่เป็นอันตราย และสิ่งอื่น ๆ ที่เป็นอันตรายต่อสุขภาพของผู้บริโภค โดยมีห้องปฏิบัติการควบคุมคุณภาพเพื่อทดสอบวัตถุดิบ สภาพแวดล้อมในระหว่างการผลิตและผลิตภัณฑ์สำเร็จรูป

นอกจากนี้ การดำเนินงานของเบทาโกรยังเป็นไประเบียบข้อบังคับระหว่างประเทศในกรณีที่จำเป็น ซึ่งที่ผ่านมาเบทาโกรได้รับการรับรองมาตรฐานสากลต่าง ๆ ไม่ว่าจะเป็น GMP HACCP RWA ISO 9001, 14001, 45001, 22000 และ 50001 รวมถึง SMETA เป็นต้น และเพื่อให้ได้การรับรองมาตรฐานเหล่านี้อย่างต่อเนื่อง บริษัทฯต้องผ่านการตรวจสอบประจำปีจากหน่วยงานรับรอง เบทาโกรยังทำการประเมินตนเองประจำเดือน และการตรวจสอบโดยไม่แจ้งล่วงหน้า รวมถึงมีรายงานประจำเดือนอย่างต่อเนื่อง เพื่อติดตาม ตรวจสอบประสิทธิภาพของขั้นตอนการควบคุม และให้มั่นใจว่าการดำเนินงานของเบทาโกรเป็นไปตามมาตรฐานที่เกี่ยวข้องอย่างเคร่งครัด